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窖藏準備窖藏的西葫蘆宜選用主蔓上第二個瓜，根瓜不宜貯藏。生長期間最好避免西葫蘆直接著地，并要防止陽光暴曬。采收時謹防機械損傷，特別要禁止滾動、拋擲，否則內瓤震動受傷易導致腐爛。西葫蘆采收后，宜在24~27℃條件下放置2周，使瓜皮硬化，這對成熟度較差的西葫蘆尤為重要。
堆藏在空室內地面上鋪好麥草，將老熟瓜的瓜蒂向外、瓜頂向內依次碼成圓堆形，每堆15~25個瓜，以5~6層為宜。也可裝筐貯藏，筐內不要裝得太滿，瓜筐堆放以3~4層為宜。堆碼時應留出通道。貯藏前期氣溫較高，晚上應開窗通風換氣，白天關閉遮陽。氣溫低時關閉門窗防寒，溫度保持在0℃以上。
架藏在空屋內，用竹、木或鋼筋做成分層的貯藏架，架底墊上草袋，將瓜堆在架子上，或用板條箱墊一層麥秸作為容器。此法透風散熱效果比堆藏好，貯藏容量大，便于檢查，其它管理辦法同堆藏法。
嫩瓜貯藏嫩瓜應貯藏在溫度5~10℃及相對濕度95%的環境條件下，采收、分級、包裝、運輸時應輕拿輕放，不要損傷瓜皮，按級別用軟紙逐個包裝，放在筐內或紙箱內貯藏。臨時貯存時要盡量放在陰涼通風處，有條件的可貯存在適宜溫度和濕度的冷庫內。在冬季長途運輸時，還要用棉被和塑料布密封覆蓋，以防凍傷。一般可貯藏2周。